Исследователи, занимающиеся изучением инфекционных заболеваний, обнаружили вирус Pteropine orthoreovirus (PRV), переносимый летучими мышами, в хранящихся мазках из горла и вирусных культурах пяти пациентов в Бангладеш. Изначально у этих людей подозревали заражение вирусом Нипах, однако последующие тесты дали отрицательный результат. Это открытие расширяет список вирусов, передающихся от животных к человеку, выявленных в стране, и подчеркивает необходимость учитывать PRV при диагностике заболеваний, схожих с инфекцией Нипах. Результаты исследования опубликованы в журнале Emerging Infectious Diseases.

Связь с употреблением сока финиковой пальмы

Все пятеро пациентов незадолго до заболевания употребляли в пищу сырой сок финиковой пальмы — сладкую жидкость, которую обычно собирают зимой и к которой часто прилетают летучие мыши. Этот сок уже известен как основной путь передачи вируса Нипах в Бангладеш. Летучие мыши признаны естественными резервуарами многих зоонозных вирусов, включая бешенство, Нипах, Хендра, Марбург и SARS-CoV-1. Как отмечает Нишай Мишра, доцент эпидемиологии Центра инфекций и иммунитета (CII) Школы общественного здравоохранения Колумбийского университета и старший автор исследования, риск заболеваний, связанных с употреблением сырого сока финиковой пальмы, выходит за пределы вируса Нипах. Это подчеркивает важность широких программ эпиднадзора для выявления и снижения рисков для общественного здоровья от новых вирусов, переносимых летучими мышами.

Ход исследования и методы диагностики

С декабря 2022 по март 2023 года пятеро пациентов были госпитализированы с симптомами, типичными для инфекции вирусом Нипах: лихорадка, рвота, головная боль, усталость, повышенное слюноотделение и неврологические проявления. Несмотря на эти признаки, лабораторные тесты с использованием ПЦР и серологии исключили вирус Нипах. Для дальнейшего анализа ученые применили высокопроизводительное секвенирование вирусов (VCS) к образцам пациентов, что позволило выявить генетический материал PRV в архивных мазках из горла. В трех случаях удалось вырастить вирус в культуре, подтвердив наличие активной инфекции.

Пациенты были выявлены в рамках программы эпиднадзора за вирусом Нипах, которую совместно реализуют Институт эпидемиологии, контроля и исследований заболеваний (IEDCR, Бангладеш), Международный центр исследований диарейных заболеваний (icddr,b, Бангладеш) и Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC).

Технологии секвенирования и их значение

Секвенирование вирусов (VCS) — это запатентованный метод, разработанный в CII Колумбийского университета. Он позволяет ученым выявлять все известные вирусные инфекции у позвоночных, включая вирусы, переносимые летучими мышами. Эта технология сопоставима по чувствительности со стандартным ПЦР-тестированием, но одновременно ищет тысячи вирусов и генерирует почти полные геномные последовательности. Связанный инструмент, секвенирование бактерий (BCS), выявляет патогенные бактерии и гены, связанные с устойчивостью к антибиотикам. Обе технологии одобрены для использования в клинических и исследовательских целях.

Особенности клинической картины и эпидемиологические выводы

Все пять пациентов перенесли тяжелое заболевание. В то же время инфекции PRV, зарегистрированные в соседних странах, часто протекали легче, что может указывать на то, что менее тяжелые случаи в Бангладеш остаются невыявленными.

По словам Тахмины Ширин, директора Института эпидемиологии, контроля и исследований заболеваний (IEDCR) и Национального центра по гриппу (NIC) в Бангладеш, новое зоонозное заражение вызывает респираторные и неврологические осложнения после употребления сырого сока финиковой пальмы наряду с инфекцией вирусом Нипах.

Поиск источника инфекции и дальнейшие исследования

В более поздней работе, поддержанной Министерством сельского хозяйства США, Мишра и его коллеги определили вероятный источник инфекции, обнаружив генетически схожие Pteropine orthoreovirus у летучих мышей, пойманных рядом с местом возникновения человеческих случаев, вблизи бассейна реки Падма (неопубликованные данные).

Арифул Ислам, эколог и эпидемиолог по болезням, переносимым летучими мышами (Университет Чарльза Стёрта, Австралия), отмечает, что исследование предоставляет важные доказательства связи резервуаров летучих мышей с заражением человека. Сейчас ученые работают над пониманием механизмов передачи от летучих мышей к людям и домашним животным, а также изучают экологию новых вирусов, переносимых летучими мышами, в сообществах вдоль бассейна реки Падма.

Участники и финансирование

В исследовании приняли участие Шармин Султана, доцент вирусологии и старший научный сотрудник IEDCR в Бангладеш, а также другие специалисты из CII, IEDCR, icddr,b, CDC и Министерства сельского хозяйства США. Финансирование осуществлялось по соглашениям Министерства сельского хозяйства США с Колумбийским университетом.